Genom živi fosil otkriti tajne ekstremnih opstanak

U evoluciji pojedinih vrsta organizama postupno zamijenjen drugim. Mnogi idu u zaborav, ali ima i onih koji su relativno malo mijenja tijekom cijelog milijun godina, sve do današnjih dana. Takav dugovječnost se zove živi fosili, a razlozi njihova evolucijskog uspjeha s velikim žarom znanstvenici nastoje riješiti. Jedan od njih je ginko drvo - golosjemenjača relikt biljka koja raste u Kini.

Fosilna ginkgo list, što je oko 49 milijuna godina gotovo ne razlikuje od modernog rođaka.
Foto Ninjatacoshell CC BY-SA preko Zajedničkog poslužitelja.

U ovom trenutku, obitelj gingkovyh, predstavljao samo jedan rod u kojem postoji samo jedan pogled - Ginkgo biloba (Ginkgo biloba). U isto vrijeme, postoje fosilni uzorci povezanih vrsta koje pripadaju perma razdoblja i datiraju 270 milijuna godina. Na svojem vrhuncu, i to u sredini jurske, obitelj je imala oko 15 rodova.

Održivost ginko jedinstven. Jedan od najupečatljivijih dokaza za to je i činjenica da su ti stabla su među nekoliko organizama koji su preživjeli eksploziju nuklearne bombe u japanskom gradu Hirošimi 1945. godine.

Vjerojatno ista svojstva im je omogućilo da prežive razdoblja glacijacije u Zemljinoj povijesti, koji je uništio mnoge druge vrste biljaka. Osim toga, ginkgo luče razne kemikalije za zaštitu od insekata, gljivica i bakterija.

Ako želite naučiti tajne prirode, ne postoji direktni način od genoma. To je ono što je učinio s Gingko tim kineskih istraživača iz Pekinga genomiku Instituta (BGI), Sveučilište Chzheytszyanskogo (Zheijiang University) i Kineske akademije znanosti (CAS).

Zadatak nije bio lagan i zahtijeva napore mnogih stručnjaka, kao i određene tehničke sposobnosti kao genom ovog jedinstvenog biljka sadrži više od 10 milijardi parova baza (za usporedbu, ljudski genom ima "samo" oko tri milijarde parova baza). Samo iznos primljenih sirovih podataka uzeo dva terabajta memorije. Istraživači vjeruju da je takva velika površina može biti posljedica punog udvostručenje genom biljke.

Jedan od amazing značajke ovog slijed je izuzetno visok postotak ponavljaju parcela - 76,58%, što ranije nisu uočene u bilo koje druge vrste.

Ona naglašava jedinstvenost ginka i njegovo mjesto u evolucijskom stablu biljke. U službenom priopćenju, studija prof Zhao Yunpen (Yunpeng Zhao) govori da ginkgo je jedan od pet postojećim odjelima sjeme biljaka i nema žive rođake.

Čitanje genoma - prvi korak do otkrivanja svih tajni prirode. Sada pred znanstvenicima je ogroman neobrađena polja, gdje će potrošiti više od jedne godine. Vrlo je vjerojatno da je rezultat njihovog rada će opisati jedinstvene molekularne mehanizme biljaka opstanak, što će pomoći, između ostalog, da nahrani čovječanstvo u budućnosti.

Članak s prvim rezultatima studije objavljene u izdanju GigaScience.